2000.09（時間不確定）

此次評鑑項目調整為「地點環境」、「硬體設計」、「所內管理及動物福祉」、「行政業務」、「總分」。

評鑑結果：「地點環境」，以新竹市、高雄市、台中市、南投市、台南市、台北市、台北縣板橋市、新莊市、蘆洲市及澎湖縣馬公市的地點較適合；「硬體設計」，以南投市、台北市、台中市、台北縣板橋市、桃園縣八德市及台南市較理想；「所內管理及動物福祉」，則以台南市、台中市、南投市、彰化縣員林鎮、台北縣新店市、八里鄉、三芝鄉及高雄市情況較好；「行政業務」，高雄市、台南市、台中市、南投市、台北市及台北縣淡水鎮成績較佳。整體成績上，台南市、台中市、南投市、高雄市及台北市的成績最好。